会泽黑颈鹤国家级自然保护区生态环境日趋向好，生物多样性不断丰富。目前，国家一级保护动物黑颈鹤数量由2018年的860余只增至1389只，占全世界黑颈鹤总数的8.5%；新记录白头鹤、沙丘鹤、彩鹮、反嘴鹬、大火烈鸟、紫水鸡等物种，保护区鸟类种群数量由179种增至214种；白骨顶鸡、斑嘴鸭、小？䴘、黑水鸡、白鹭、苍鹭、绿头鸭、红眼潜鸭等部分候鸟变留鸟，在保护区筑巢繁殖。